Сервер MCP PubMed

значок кузнеца

🔍 Предоставьте помощникам на основе искусственного интеллекта возможность искать, получать доступ и анализировать статьи PubMed с помощью простого интерфейса MCP.

Сервер PubMed MCP обеспечивает мост между помощниками ИИ и обширным хранилищем биомедицинской литературы PubMed через протокол контекста модели (MCP). Он позволяет моделям ИИ искать научные статьи, получать доступ к их метаданным и выполнять глубокий анализ программным способом.

🤝 Внести свой вклад • 📝 Сообщить об ошибке

✨ Основные характеристики

🔎 Поиск статей: поиск статей PubMed по ключевым словам или расширенный поиск ✅
🚀 Эффективный поиск: быстрый доступ к метаданным на бумаге ✅
📊 Доступ к метаданным: получение подробных метаданных для определенных статей ✅
📊 Поддержка исследований: содействие исследованиям и анализу в области биомедицинских наук ✅
📄 Доступ к бумажным документам: попытка загрузить полный текст PDF-контента ✅
🧠 Глубокий анализ: выполните комплексный анализ документов ✅
📝 Подсказки для исследования: набор специализированных подсказок для анализа статей ✅

Related MCP server: PubMed MCP Server

🚀 Быстрый старт

Предпосылки

Питон 3.10+
Библиотека FastMCP

Установка

Установка через Smithery

Чтобы автоматически установить pubmed-mcp-server для Claude Desktop через Smithery :

Клод

npx -y @smithery/cli install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client claude

Курсор

Вставьте следующее в Настройки → Настройки курсора → MCP → Добавить новый сервер:

Мак/Линукс

npx -y @smithery/cli@latest run @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cursor --config "{}"

Виндсерфинг

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client windsurf --config "{}"

CЛиния

npx -y @smithery/cli@latest install @JackKuo666/pubmed-mcp-server --client cline --config "{}"

Клонируйте репозиторий:
git clone https://github.com/JackKuo666/PubMed-MCP-Server.git cd PubMed-MCP-Server
Установите необходимые зависимости:
pip install -r requirements.txt

📊 Использование

Запустите MCP-сервер:

python pubmed_server.py

Использование с Claude Desktop

Добавьте эту конфигурацию в ваш claude_desktop_config.json :

(Mac OS)

{ "mcpServers": { "pubmed": { "command": "python", "args": ["-m", "pubmed-mcp-server"] } } }

(Версия для Windows):

{ "mcpServers": { "pubmed": { "command": "C:\\Users\\YOUR\\PATH\\miniconda3\\envs\\mcp_server\\python.exe", "args": [ "D:\\code\\YOUR\\PATH\\PubMed-MCP-Server\\pubmed_server.py" ], "env": {}, "disabled": false, "autoApprove": [] } } }

Использование с Клайном

{ "mcpServers": { "pubmed": { "command": "bash", "args": [ "-c", "source /home/YOUR/PATH/mcp-server-pubmed/.venv/bin/activate && python /home/YOUR/PATH/pubmed-mcp-server.py" ], "env": {}, "disabled": false, "autoApprove": [] } } }

🛠 Инструменты MCP

Сервер PubMed MCP предоставляет следующие инструменты:

search_pubmed_key_words : Поиск статей на PubMed по ключевым словам.
search_pubmed_advanced : Выполнить расширенный поиск статей в PubMed по нескольким параметрам.
get_pubmed_article_metadata : извлечение метаданных для статьи PubMed с использованием ее PMID.
download_pubmed_pdf : попытка загрузить полный текст статьи PubMed в формате PDF.
deep_paper_analysis : выполнить комплексный анализ статьи PubMed.

Поиск статей

Вы можете попросить ИИ-помощника поискать документы, используя такие запросы:

Can you search PubMed for recent papers about CRISPR?

Получение бумажных данных

Получив PMID, вы можете запросить более подробную информацию:

Can you show me the metadata for the paper with PMID 12345678?

Анализ документов

Вы можете запросить глубокий анализ статьи:

Can you perform a deep analysis of the paper with PMID 12345678?

📁 Структура проекта

pubmed_server.py : Основная реализация сервера MCP с использованием FastMCP
pubmed_web_search.py : Содержит логику поиска PubMed и получения информации о статьях.

🔧 Зависимости

Питон 3.10+
FastMCP
асинк
ведение журнала
запросы
beautifulsoup4

🤝 Вклад

Вклады приветствуются! Пожалуйста, не стесняйтесь отправлять запрос на включение.

📄 Лицензия

Данный проект лицензирован по лицензии MIT.

⚠️ Отказ от ответственности

Этот инструмент предназначен только для исследовательских целей. Пожалуйста, уважайте условия обслуживания PubMed и используйте этот инструмент ответственно.

This server cannot be installed

-

security - not tested

A

license - permissive license

-

quality - not tested

How are these scores calculated?

Resources

GitHub Repository

Need Help?

Report Issue

Related Servers

PubMed-MCP-Server