顺势疗法
使用自然语言进行 scRNA-Seq 分析的 MCP 服务器！
🪩 它能做什么？
IO 模块，例如使用自然语言读取和写入 scRNA-Seq 数据
预处理模块，如过滤、质量控制、标准化、缩放、高度可变基因、PCA、邻居等。
工具模块，如聚类、差异表达等。
绘图模块，例如小提琴图、热图、点图
细胞间通讯分析
Related MCP server: Zanny's Persistent Memory Manager
❓ 这是给谁的？
任何想要进行 scRNA-Seq 分析自然语言的人！
想要为其应用程序调用 scanpy 函数的代理开发人员
🌐 在哪里使用它？
您可以在大多数支持 MCP 的 AI 客户端、插件或代理框架中使用 scmcp：
AI客户端，例如Cherry Studio
插件，例如 Cline
代理框架，例如 Agno
🎬 演示
演示 AI 客户端 Cherry Studio 中使用基于 scmcp 的自然语言进行 scRNA-Seq 细胞聚类分析
https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559
🏎️ 快速入门
安装
从 PyPI 安装
pip install scmcp
你可以通过运行来测试它
scmcp run
在本地运行 scnapy-server
在您的 MCP 客户端中参考以下配置：
"mcpServers": {
"scmcp": {
"command": "scmcp",
"args": [
"run"
]
}
}
远程运行 scnapy-server
在您的 MCP 客户端中参考以下配置：
在您的服务器上运行它
scmcp run --transport sse --port 8000
然后配置您的 MCP 客户端，如下所示：
http://localhost:8000/sse
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