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SCMCP

by huang-sh
GitHub
Python
BSD 3-Clause
10
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顺势疗法

使用自然语言进行 scRNA-Seq 分析的 MCP 服务器！

🪩 它能做什么？

  • IO 模块，例如使用自然语言读取和写入 scRNA-Seq 数据
  • 预处理模块，如过滤、质量控制、标准化、缩放、高度可变基因、PCA、邻居等。
  • 工具模块，如聚类、差异表达等。
  • 绘图模块，例如小提琴图、热图、点图
  • 细胞间通讯分析

❓ 这是给谁的？

  • 任何想要进行 scRNA-Seq 分析自然语言的人！
  • 想要为其应用程序调用 scanpy 函数的代理开发人员

🌐 在哪里使用它？

您可以在大多数支持 MCP 的 AI 客户端、插件或代理框架中使用 scmcp：

  • AI客户端，例如Cherry Studio
  • 插件，例如 Cline
  • 代理框架，例如 Agno

🎬 演示

演示 AI 客户端 Cherry Studio 中使用基于 scmcp 的自然语言进行 scRNA-Seq 细胞聚类分析

https://github.com/user-attachments/assets/93a8fcd8-aa38-4875-a147-a5eeff22a559

🏎️ 快速入门

安装

从 PyPI 安装

pip install scmcp

你可以通过运行来测试它

scmcp run
在本地运行 scnapy-server

在您的 MCP 客户端中参考以下配置：

"mcpServers": { "scmcp": { "command": "scmcp", "args": [ "run" ] } }
远程运行 scnapy-server

在您的 MCP 客户端中参考以下配置：

在您的服务器上运行它

scmcp run --transport sse --port 8000

然后配置您的 MCP 客户端，如下所示：

http://localhost:8000/sse

🤝 贡献

如有任何疑问，欢迎提交 issue，或联系我 ( hsh-me@outlook.com )。也欢迎您为代码做出贡献！

Install Server
A
security – no known vulnerabilities
A
license - permissive license
A
quality - confirmed to work

How are these scores calculated?

hybrid server

The server is able to function both locally and remotely, depending on the configuration or use case.

一种 MCP 服务器，可通过自然语言进行单细胞 RNA 测序分析，支持数据处理、可视化和分析任务，而无需编码知识。

  1. 🪩 它能做什么？
    1. ❓ 这是给谁的？
      1. 🌐 在哪里使用它？
        1. 🎬 演示
          1. 🏎️ 快速入门
            1. 安装
          2. 🤝 贡献

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